La historia de Bordón transcurre íntimamente ligada a la villa de Castellote. Castellote se incorporó junto a Cantavieja a las posesiones de Alfonso II el Casto, quien llegará en sus conquistas hasta Teruel en 1171. En 1188 Castellote y con él Bordón pasarán a pertenecer a la Orden de San Redentor debido a que el señor de la villa, Gascón de Castellot formaba parte de esta orden. Más tarde Castellote y Bordón junto con el resto de posesiones del San Redentor pasarán a manos de los templarios. El periodo de dominación templario es importante para la población de Bordón, ya que es en ese tiempo en que se surge la devoción a la Virgen de la Carrasca que supuso la creación de un convento, una iglesia para albergarla. Además en 1300 los templarios concedieron Privilegios de Fundación y Población a aquellos que se quisiesen instalar en los alrededores del convento. Hoy podemos contemplar la iglesia aunque transformada conservando su aspecto medieval. Pocos años después de la concesión de los Privilegios templarios para poblar la zona, estos monjes guerreros son expulsados de la iglesia y muchas sus posesiones pasan a manos de la Orden de San Juan del Hospital, como es el caso de Castellote y por lo tanto de Bordón. La zona continuará bajo dominio Sanjuanista hasta bien entrado el siglo XVIII. Fue testigo de los enfrentamientos durante las guerras carlistas y padeció las consecuencias de la Guerra Civil. Posteriormente ha sufrido, como todos los pueblos de la comarca, los efectos de una fuerte emigración.